非官方中文翻译 本页译自 MNE-Python 官方文档: 查看英文原文 ↗。 文档版权归 MNE Developers 所有(BSD-3-Clause)。

教程#

这些教程针对最常见的 MNE-Python 分析任务,提供叙述性讲解、示例代码和预期输出。教程强调把原理讲透,帮助新用户快速上手,因此只覆盖有限的主题。各章节与教程按固定顺序编排,理论上新用户可以按顺序学习,而不会遇到未解释的背景知识。对于已经熟悉其他 EEG/MEG 分析软件的经验用户,也可以直接跳转到需要的主题。

注意

如果教程脚本包含绘图,并在本地运行,可使用 python -i tutorial_script.py 的交互模式让图形保持打开。

入门教程#

这些教程覆盖事件相关分析的基本 EEG/MEG 流程,介绍 mne.Info、事件和 mne.Annotations 数据结构,讨论传感器位置的处理方式,并介绍一些可用的配置选项。

MNE-Python MEG/EEG 分析概览

MNE-Python MEG/EEG 分析概览

原地修改数据

原地修改数据

从原始数据中解析事件

从原始数据中解析事件

Info 数据结构

Info 数据结构

处理传感器位置

处理传感器位置

配置 MNE-Python

配置 MNE-Python

开始使用 mne.Report

开始使用 mne.Report

读取不同记录系统的数据#

这些教程介绍如何将各种记录设备的 EEG/MEG 数据加载到 MNE-Python 中。

从 MEG 设备导入数据

从 MEG 设备导入数据

导入 EEG 设备数据

导入 EEG 设备数据

导入 fNIRS 设备数据

导入 fNIRS 设备数据

处理 CTF 数据:Brainstorm 听觉数据集

处理 CTF 数据:Brainstorm 听觉数据集

导入眼动追踪设备数据

导入眼动追踪设备数据

处理连续数据#

这些教程介绍如何将 EEG/MEG 数据加载到 MNE-Python,以及如何查询、操作、标注、绘制和导出 Raw 格式的连续数据。

Raw 数据结构:连续数据

Raw 数据结构:连续数据

处理事件

处理事件

标注连续数据

标注连续数据

Raw 对象的内置绘图方法

Raw 对象的内置绘图方法

预处理#

这些教程介绍连续数据的各种预处理技术,以及一些诊断性绘图方法。

伪迹检测概览

伪迹检测概览

使用 mne.Report 创建质量控制(QC)报告

使用 mne.Report 创建质量控制(QC)报告

处理坏导联

处理坏导联

剔除坏数据段与中断

剔除坏数据段与中断

滤波背景知识

滤波背景知识

滤波与重采样

滤波与重采样

使用回归修复伪迹

使用回归修复伪迹

使用 ICA 修复伪迹

使用 ICA 修复伪迹

投影器与投影背景知识

投影器与投影背景知识

使用 SSP 修复伪迹

使用 SSP 修复伪迹

设置 EEG 参考

设置 EEG 参考

去除 fMRI 梯度伪迹

去除 fMRI 梯度伪迹

提取并可视化受试者头部运动

提取并可视化受试者头部运动

信号空间分离(SSS)与 Maxwell 滤波

信号空间分离(SSS)与 Maxwell 滤波

预处理功能性近红外光谱(fNIRS)数据

预处理功能性近红外光谱(fNIRS)数据

光泵磁力仪(OPM)MEG 数据预处理

光泵磁力仪(OPM)MEG 数据预处理

在 MNE-Python 中处理眼动追踪数据

在 MNE-Python 中处理眼动追踪数据

将连续数据分段为 Epochs#

这些教程介绍分段(Epochs)数据,以及它与连续数据处理方式的区别。

Epochs 数据结构:不连续数据

Epochs 数据结构:不连续数据

基于回归的基线校正

基于回归的基线校正

可视化分段数据(Epochs)

可视化分段数据(Epochs)

处理 Epoch 元数据

处理 Epoch 元数据

自动生成 Epochs 元数据

自动生成 Epochs 元数据

将 Epochs 导出为 Pandas DataFrame

将 Epochs 导出为 Pandas DataFrame

将连续数据切分为等间隔 Epoch

将连续数据切分为等间隔 Epoch

估计诱发响应#

这些教程介绍如何估计诱发响应(即对同一实验条件的多次重复试次进行平均)。

Evoked 数据结构:诱发/平均数据

Evoked 数据结构:诱发/平均数据

可视化 Evoked 数据

可视化 Evoked 数据

EEG 分析:事件相关电位(ERP)

EEG 分析:事件相关电位(ERP)

绘制白化数据

绘制白化数据

时频分析#

这些教程介绍神经信号的频域与时频分析。

Spectrum 与 EpochsSpectrum 类:频域数据

Spectrum 与 EpochsSpectrum 类:频域数据

传感器层面的频率与时频分析

传感器层面的频率与时频分析

频率标记:SSVEP/vSSR 数据集基础分析

频率标记:SSVEP/vSSR 数据集基础分析

正向模型与源空间#

这些教程介绍如何定义皮层源位置(源空间)和正向模型(也称导联场矩阵)。

FreeSurfer MRI 重建

FreeSurfer MRI 重建

源空间对齐与坐标框架

源空间对齐与坐标框架

使用自动配准方法

使用自动配准方法

头模型与正向计算

头模型与正向计算

使用模板 MRI 计算 EEG 前向算子

使用模板 MRI 计算 EEG 前向算子

MNE 如何使用 FreeSurfer 输出

MNE 如何使用 FreeSurfer 输出

修复 BEM 与头部表面

修复 BEM 与头部表面

计算协方差矩阵

计算协方差矩阵

源定位与逆问题#

这些教程介绍如何从传感器记录中估计皮层活动。

SourceEstimate 数据结构

SourceEstimate 数据结构

使用等效电流偶极子(ECD)拟合进行源定位

使用等效电流偶极子(ECD)拟合进行源定位

使用引导式等效电流偶极子(ECD)拟合进行源定位

使用引导式等效电流偶极子(ECD)拟合进行源定位

使用 MNE、dSPM、sLORETA 和 eLORETA 进行源定位

使用 MNE、dSPM、sLORETA 和 eLORETA 进行源定位

偶极子方向在分布式源定位中的作用

偶极子方向在分布式源定位中的作用

计算多种 MNE 解

计算多种 MNE 解

使用 LCMV 波束形成器进行源重建

使用 LCMV 波束形成器进行源重建

可视化源时间过程(STC)

可视化源时间过程(STC)

基于 MRI 电极位置的 EEG 源定位

基于 MRI 电极位置的 EEG 源定位

Brainstorm Elekta 体模数据集教程

Brainstorm Elekta 体模数据集教程

Brainstorm CTF 体模数据集教程

Brainstorm CTF 体模数据集教程

4D Neuroimaging/BTi 体模数据集教程

4D Neuroimaging/BTi 体模数据集教程

KIT 体模数据集教程

KIT 体模数据集教程

传感器数据的统计分析#

这些教程介绍传感器级数据的一些统计分析方法。

统计推断

统计推断

可视化 EEG 数据的统计显著性阈值

可视化 EEG 数据的统计显著性阈值

单试次功率的非参数单样本聚类统计

单试次功率的非参数单样本聚类统计

单试次功率的非参数条件间聚类统计

单试次功率的非参数条件间聚类统计

单试次功率的质量单变量双因素重复测量 ANOVA

单试次功率的质量单变量双因素重复测量 ANOVA

全传感器数据的时空置换 F 检验

全传感器数据的时空置换 F 检验

源估计的统计分析#

这些教程介绍源估计的受试者内统计分析。

使用时空聚类对源数据进行置换 t 检验

使用时空聚类对源数据进行置换 t 检验

源空间数据的时空聚类两样本置换检验

源空间数据的时空聚类两样本置换检验

使用时空聚类对源数据进行重复测量 ANOVA

使用时空聚类对源数据进行重复测量 ANOVA

神经活动的机器学习模型#

这些教程介绍 MNE-Python 提供的一些机器学习方法。

连续数据的频谱-时间感受野(STRF)估计

连续数据的频谱-时间感受野(STRF)估计

解码(MVPA)

解码(MVPA)

跨位置泛化(GAL)解码与 TimeGAL

跨位置泛化(GAL)解码与 TimeGAL

临床应用#

这些教程展示一些临床应用场景。

MNE-GUI-addons 示例#

mne_gui_addons 包支持一些临床应用场景:

定位颅内电极触点

定位颅内电极触点

MNE-Python 示例#

MNE-Python 也直接支持一些临床应用场景:

处理 sEEG 数据

处理 sEEG 数据

处理 ECoG 数据

处理 ECoG 数据

基于多导睡眠图(PSG)数据的睡眠分期

基于多导睡眠图(PSG)数据的睡眠分期

仿真#

这些教程介绍如何使用基于数组的构造函数和 simulation 子模块,把任意数据填充到 MNE-Python 数据结构中。

从零创建 MNE-Python 数据结构

从零创建 MNE-Python 数据结构

用点扩散污染已知信号

用点扩散污染已知信号

使用 DICS 进行功率映射

使用 DICS 进行功率映射

可视化教程#

这些教程介绍 MNE-Python 提供的高级可视化选项,例如如何生成出版级图表,或如何让图形更具交互性。

让图表更符合出版要求

让图表更符合出版要求

使用事件系统联动图表

使用事件系统联动图表

图库由 Sphinx-Gallery 生成